MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p1META1

Total Repeats: 1072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012807	TCGGCC	2	12	6	17	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012807	CG	3	6	26	31	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012807	CGC	2	6	59	64	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_012807	GGC	2	6	98	103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012807	CGG	2	6	117	122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012807	GCG	2	6	179	184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012807	CGA	2	6	256	261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012807	GCC	2	6	273	278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_012807	CGG	2	6	283	288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012807	CGG	2	6	293	298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012807	AGC	2	6	366	371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012807	GCC	2	6	403	408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_012807	AGA	2	6	423	428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012807	CCTCGG	2	12	433	444	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012807	GCC	3	9	499	507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_012807	GAC	2	6	530	535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012807	CGA	2	6	580	585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012807	CGC	2	6	589	594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_012807	GGC	2	6	601	606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012807	GCGCG	2	10	666	675	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_012807	CCG	2	6	727	732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_012807	GGC	2	6	766	771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012807	GTC	2	6	818	823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012807	GCC	2	6	826	831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_012807	GAG	2	6	839	844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012807	TCGG	2	8	894	901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012807	CCG	2	6	917	922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_012807	GGC	2	6	943	948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012807	CG	3	6	1107	1112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012807	CGGA	2	8	1212	1219	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012807	CGA	2	6	1221	1226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012807	GCCT	2	8	1243	1250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012807	GC	3	6	1260	1265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012807	TCGA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012807	CAC	3	9	1398	1406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_012807	GCTG	2	8	1491	1498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012807	GCC	2	6	1526	1531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_012807	CGCC	2	8	1544	1551	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_012807	TCG	2	6	1649	1654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012807	CG	3	6	1658	1663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012807	CTT	2	6	1690	1695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012807	GCC	2	6	1822	1827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_012807	TCG	2	6	1829	1834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012807	GCC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_012807	CGT	2	6	1920	1925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012807	GAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012807	CACG	2	8	2004	2011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012807	GCACG	3	15	2007	2021	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
49	NC_012807	ACCG	2	8	2029	2036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012807	CGC	2	6	2043	2048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012807	CCT	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_012807	ACG	2	6	2114	2119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012807	CCT	2	6	2130	2135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_012807	CCT	2	6	2187	2192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_012807	CCG	2	6	2195	2200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_012807	CG	4	8	2254	2261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012807	GCC	2	6	2320	2325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_012807	CGG	2	6	2463	2468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012807	TCC	2	6	2474	2479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_012807	CGC	2	6	2484	2489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_012807	GCG	2	6	2505	2510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012807	CG	4	8	2610	2617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012807	GCC	2	6	2671	2676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_012807	GCG	2	6	2757	2762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012807	ACCGTC	2	12	2764	2775	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012807	CCG	2	6	2788	2793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_012807	GC	3	6	2836	2841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012807	CGA	2	6	2901	2906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012807	CGC	2	6	2910	2915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_012807	GCC	2	6	2921	2926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_012807	GC	3	6	2940	2945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012807	TCC	2	6	2987	2992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_012807	TCA	2	6	3000	3005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012807	GC	3	6	3009	3014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012807	GGT	2	6	3129	3134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012807	AGC	2	6	3191	3196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012807	CGA	2	6	3222	3227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012807	CTA	2	6	3303	3308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012807	ACG	2	6	3335	3340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012807	CCAC	2	8	3510	3517	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_012807	GCC	2	6	3603	3608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_012807	GGC	2	6	3613	3618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012807	CTC	2	6	3646	3651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_012807	GCG	2	6	3826	3831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012807	GAGC	2	8	3832	3839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_012807	CGG	2	6	3840	3845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012807	G	6	6	3866	3871	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012807	TTGT	2	8	3928	3935	0 %	75 %	25 %	0 %	240111941
89	NC_012807	GAT	2	6	4091	4096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240111941
90	NC_012807	CGC	2	6	4119	4124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_012807	GC	3	6	4133	4138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012807	GC	3	6	4225	4230	0 %	0 %	50 %	50 %	240111942
93	NC_012807	TGG	2	6	4235	4240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111942
94	NC_012807	CGT	2	6	4251	4256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111942
95	NC_012807	CGC	2	6	4311	4316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
96	NC_012807	CGC	2	6	4376	4381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
97	NC_012807	CGA	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111942
98	NC_012807	GC	3	6	4480	4485	0 %	0 %	50 %	50 %	240111942
99	NC_012807	TCCCC	2	10	4506	4515	0 %	20 %	0 %	80 %	240111942
100	NC_012807	GCT	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111942
101	NC_012807	CCG	2	6	4642	4647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
102	NC_012807	CGG	2	6	4704	4709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111942
103	NC_012807	CCG	2	6	4763	4768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
104	NC_012807	CGC	2	6	4803	4808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
105	NC_012807	GAC	2	6	4816	4821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111942
106	NC_012807	TCG	2	6	4880	4885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111942
107	NC_012807	GCT	2	6	4923	4928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111942
108	NC_012807	GCG	2	6	4930	4935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111942
109	NC_012807	TCT	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240111942
110	NC_012807	GC	3	6	4981	4986	0 %	0 %	50 %	50 %	240111942
111	NC_012807	GCA	2	6	4998	5003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111942
112	NC_012807	GCC	2	6	5017	5022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
113	NC_012807	GTG	2	6	5039	5044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240111942
114	NC_012807	AGG	2	6	5045	5050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111942
115	NC_012807	C	6	6	5091	5096	0 %	0 %	0 %	100 %	240111942
116	NC_012807	GCC	2	6	5123	5128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111942
117	NC_012807	TTC	2	6	5243	5248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240111942
118	NC_012807	GAA	2	6	5257	5262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240111942
119	NC_012807	CGA	2	6	5310	5315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111942
120	NC_012807	CAT	2	6	5381	5386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012807	CA	3	6	5408	5413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_012807	GAG	2	6	5433	5438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012807	GC	3	6	5448	5453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_012807	CTT	2	6	5460	5465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012807	CCT	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_012807	AAG	2	6	5493	5498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012807	TCC	2	6	5518	5523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_012807	GCT	2	6	5540	5545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012807	CGA	2	6	5573	5578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012807	TCC	2	6	5587	5592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_012807	GCG	2	6	5612	5617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012807	CAT	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012807	GCA	2	6	5647	5652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012807	TCGG	2	8	5663	5670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_012807	GGC	2	6	5689	5694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012807	GTGGA	2	10	5714	5723	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012807	CGGCG	2	10	5736	5745	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
138	NC_012807	CCGA	2	8	5752	5759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_012807	TGCA	2	8	5828	5835	25 %	25 %	25 %	25 %	240111943
140	NC_012807	CA	3	6	5834	5839	50 %	0 %	0 %	50 %	240111943
141	NC_012807	CCT	2	6	5859	5864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240111943
142	NC_012807	CTG	2	6	5911	5916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111943
143	NC_012807	GC	3	6	5918	5923	0 %	0 %	50 %	50 %	240111943
144	NC_012807	GTC	2	6	5995	6000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111943
145	NC_012807	GCG	2	6	6015	6020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111943
146	NC_012807	CCG	2	6	6036	6041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111943
147	NC_012807	CTG	2	6	6139	6144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111943
148	NC_012807	GCC	2	6	6146	6151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111943
149	NC_012807	GCG	2	6	6177	6182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111943
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158	NC_012807	GAG	2	6	6599	6604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012807	GCT	2	6	6621	6626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_012807	CG	3	6	6628	6633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_012807	CCGG	2	8	6634	6641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
162	NC_012807	CCG	2	6	6669	6674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_012807	CGG	3	9	6682	6690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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264	NC_012807	GAGAG	2	10	10714	10723	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
265	NC_012807	GAG	2	6	10756	10761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240111947
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273	NC_012807	GCC	2	6	11039	11044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240111947
274	NC_012807	TCACA	2	10	11101	11110	40 %	20 %	0 %	40 %	240111948
275	NC_012807	GCAG	2	8	11186	11193	25 %	0 %	50 %	25 %	240111948
276	NC_012807	CG	3	6	11252	11257	0 %	0 %	50 %	50 %	240111948
277	NC_012807	ACC	2	6	11287	11292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240111948
278	NC_012807	CAG	2	6	11338	11343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_012807	CG	3	6	11347	11352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
280	NC_012807	ATC	2	6	11390	11395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240111949
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282	NC_012807	ATCG	2	8	11532	11539	25 %	25 %	25 %	25 %	240111949
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411	NC_012807	CGG	2	6	16794	16799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111957
412	NC_012807	TGC	2	6	16876	16881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111957
413	NC_012807	CGG	2	6	16882	16887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111957
414	NC_012807	CGG	2	6	16897	16902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111957
415	NC_012807	GCTC	2	8	16913	16920	0 %	25 %	25 %	50 %	240111957
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443	NC_012807	ATC	3	9	18183	18191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240111957
444	NC_012807	GAT	2	6	18200	18205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240111957
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479	NC_012807	CGG	2	6	19642	19647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240111958
480	NC_012807	TCG	2	6	19674	19679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111958
481	NC_012807	ACG	2	6	19698	19703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111958
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492	NC_012807	TGT	2	6	20329	20334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240111958
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496	NC_012807	TCG	2	6	20518	20523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240111958
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498	NC_012807	CGA	2	6	20635	20640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111958
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500	NC_012807	CGA	2	6	20650	20655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240111958

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